防爆小屋结构是指防爆小屋的外形结构和内部结构。目前正压型结构和隔爆型结构涵盖了行业内所有的防爆小屋，这两种防爆小屋外形结构都是采用框架式结构，双层墙夹层设计，夹层厚度为75mm,填充阻燃型聚氨酯保温材料。屋顶坡度为A型结构，坡度不小于4%，底座采用14号槽钢和工字钢焊接后铺设地板，地板为4.5mm厚花纹钢板，地板开有4个固定机柜的螺栓孔，在地板四角焊有接地排，现在这种结构已经成为防爆小屋的基本结构。

除了基本结构相同，这两种防爆分析小屋的内部结构有一些差异，最大的差异是正压防爆小屋内部结构为双层门隔离结构，配有1平方的独立的缓冲间和门，配有进气装置和正压防爆控制系统，从分析小屋外经过缓冲间才能进入正压操作室，外门和缓冲间门不能同时打开，达到正常进出时外部气体进入防爆小屋的缓冲作用，好处在于正压型的小屋内部可以使用普通分析仪机柜和仪表。而隔爆小屋没有缓冲间，内部电气设备和分析仪机柜都要使用防爆型的，还需要给安装分析仪的防爆柜配置进行装置。